P. motoro thay đổi đáng kể về ngoại hình và hình thái trong phạm vi rộng lớn của nó,[4] và một đánh giá phân loại các quần thể Amazon được mong đợi.[5] Việc phân loại các quần thể trong lưu vực sông La Plata đã được xem xét vào năm 2013, dẫn đến phát hiện rằng P. motoro được tìm thấy hầu như xuyên suốt (vắng mặt ở phần thượng lưu của lưu vực Paraná từ đập Itaipu), nhưng cũng có hai thành viên khác của phức hợp loài này: P. amandae (phổ biến ở sông La Plata) và P. pantanensis (bắc Pantanal).[6] Hai loại Amazon rất đặc biệt hoàn toàn không có các đốm màu vàng cam viền đen: Cái gọi là "Mantilla ray", CD4, ở Peru và các vùng lân cận của Brazil, và CD5 tương tự nhưng nhạt hơn từ các con sông gần Marajó. Cả CD4 và CD5 cùng sinh sống với các biến thể bình thường của P. motoro.[4][7]Vào năm 2019, chúng được mô tả là một loài mới, P. marquesi.[8]

Các thành viên hiện được công nhận của quần thể loài được tìm thấy ở những nơi khác là P. boesemani (sông Corantijn; vắng mặt P. motoro),[9] P. jabuti (lưu vực Tapajós giữa và trên; P. motoro ở hạ lưu),[10] và P. ocellata (lưu vực sông Amazon thấp hơn), nhưng cuối cùng có thể là danh pháp đồng nghĩa của P. motoro.[11]